L'Università Pontificia Comillas ha diverse sedi a Madrid: il campus centrale (via Alberto Aguilera), il campus di Cantoblanco e il campus di Ciempozuelos (Avenida San Juan de Dios).

Il campus centrale si trova in una delle aree più tradizionali di Madrid. Se studi qui, ci sono molte opzioni di alloggio. I due quartieri meglio collegati all'università sono Chamberí (specie la Moncloa) e il Centro (specie le aree di Sol, Malasaña e Embajadores).

Dalla Moncloa puoi andare all'università a piedi in meno di 15 minuti. Il viaggio da Sol prende solo 17 minuti (linea 3 della metro e un paio di minuti a piedi). Da Malasaña puoi arrivare alla Pontificia con la linea 2 della metro che va da Santo Domingo a San Bernardo e poi camminare un paio di minuti (totale 14 minuti). Da Embajadores puoi prendere la linea 3 della metro fino a Ventura Rodríguez e poi terminare la strada a piedi. Il viaggio prende meno di 20 minuti.

Il campus di Cantoblanco si trova a nord di Madrid e ha una fermata del treno dedicata (Universidad Pontificia Comillas). Se studi a Cantoblanco, i quartieri migliori per vivere sono Letras, Las Tablas, Sanchinarro o Tetuán.

Il viaggio da Sol (Letras) all'università richiede 47 minuti con il treno C4. Puoi anche prendere lo stesso treno dalla stazione di Fuencarral a Las Tablas (circa 30 minuti). Da Sanchinarro puoi prendere il bus 173 fino a  Hospital de La Paz e dopo il 714 per arrivare al campus. Ci vogliono circa 50 minuti. Se vivi a Tetuán, puoi prendere la linea 1 della metro fino a Chamartín e poi il treno C4 fino al campus (56 minuti). 

Il campus di Ciempozuelos si trova a sud di Madrid, a metà strada con Aranjuez. I quartieri meglio collegati al campus sono Atocha (39 minuti per arrivare all'università con il treno C3), Getafe (circa 19 minuti con il treno C3 da Getafe Industrial), Centro (44 minuti in treno C3 da Sol) e Tetuán (1 ora con la metro 1 da Valdeaceras a Sol e poi il treno C3 fino a Ciempozuelos).